msd收敛性分析

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  1. 1. MSD收敛性辨析
    1. 1.同一段111单胞轨迹不同时间长度的MSD收敛性
      1. 1. 不同取点比例下的收敛性
      2. 2. 同一时间段内的收敛性 （注意纵坐标的值）
    2. 2. 333的轨迹收敛性
    3. 3. 555的收敛性
    4. 4.一段101010的轨迹的log
  2. 2. 各种msd图形鉴赏

  1. 1. MSD收敛性辨析
    1. 1.同一段111单胞轨迹不同时间长度的MSD收敛性
      1. 1. 不同取点比例下的收敛性
      2. 2. 同一时间段内的收敛性 （注意纵坐标的值）
    2. 2. 333的轨迹收敛性
    3. 3. 555的收敛性
    4. 4.一段101010的轨迹的log
  2. 2. 各种msd图形鉴赏

1. MSD收敛性辨析

==本质上MSD是统计离子的跳跃事件，单位时间或单位空间内的跳跃事件为常数时，才能得到比较线性的MSD曲线，同时得到收敛的结果==

==换言之，只要是线性的结果，就说明是收敛的，因为只有在单位时间内的跳跃数相等时，线才能是线性的，这个时候就满足了收敛的判断==

==尺寸效应有所不同的是，在每个尺寸下，得到的数据都是线性的，也就是在每个尺寸都收敛，说明随着尺寸增加，得到的单位时间单位尺寸内的跳跃数量是整体减小的。这就是尺寸效应的影响==

只有当单帧对比的MSD是线性的时候，才能说明可能收敛了，多起源的图像线性了不能证明真的线性

以后在计算之前需要先检验收敛性

==线性未必收敛==

单起源的收敛才是收敛，多起源的收敛是不得已的近似 错误的，多起源更容易判断收敛

==以后的计算需要用多起源和单起源分别判断收敛性，最好是跑一个足够长的单起源，验证多起源可以更快的判断出收敛后的数值==

用log来判断 两个log值之间相差不超过0.001或0.005

1.同一段111单胞轨迹不同时间长度的MSD收敛性

1. 不同取点比例下的收敛性

/work/home/liz/workspace/1-system-MD/1-Na5YSi4O12/6-machine-learning/4-ceshi/1-111/xda-2

10 ps

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20ps

image-20231026140300673

30ps

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40ps

image-20231026140320770

50ps

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60ps

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70ps

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80ps

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90ps

image-20231026140406491

100ps

image-20231026140418114

200ps

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300ps

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400ps

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500ps

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600ps

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700ps

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800ps

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900ps

image-20231026140547280

1000 ps

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2000ps

image-20231026091747914

3000ps

image-20231026091807338

4000ps

image-20231026091831114

5000ps

image-20231026091856011

6000ps

image-20231026140912562

7000ps

image-20231031161837793

7900ps

image-20231031161850239

image-20231102103530571

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横轴ps ，纵轴 百分比 值

image-20231102105135177

image-20231102105203532

image-20231102105236078

image-20231102105306567

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2. 同一时间段内的收敛性 （注意纵坐标的值）

横坐标 百分比 纵坐标是名称：代表时长

2. 333的轨迹收敛性

时间：*0.01 ps

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image-20231102092005094

image-20231102092016407

image-20231102092028981

image-20231102092041349

image-20231102092053830

image-20231102092105400

image-20231102092122039

image-20231102092132341

image-20231102092141334

image-20231102093704580

image-20231102093745259

3. 555的收敛性

==在计算扩散系数的过程中，随着尺度的增加，包括的不运动的钠离子数量也在增加，导致最后的计算结果不同尺寸不同 ——-这一结论是错误的，因为都除以了原子数，所以应该是相等的==

image-20231102085847605

image-20231102085905796

image-20231102085918758

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image-20231102085947636

image-20231102085959636

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image-20231102090019123

image-20231102090030242

image-20231102090042517

image-20231102090946777

image-20231102094034731

555 log(D)

多起源

image-20231102111055601

单起源

image-20231102134914820

image-20231102134831540

image-20231102134841751

111 log(D)

image-20231102111117149

image-20231102111222421

555 700ps的百分之一到百分之100

==还需要更长的计算

image-20231102153841378

image-20231102153854215

image-20231102154002907

image-20231102154057839

image-20231102154110596

image-20231102154123021

4.一段101010的轨迹的log

华为 /home/jildxwlxyljlstdui/cccs-share02/lijx/work-lijx/nlso/101010

image-20231107093828712

image-20231107093840976

222

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444

image-20231107101358450

666

image-20231107101435692

101010

image-20231107101515605

不同的模型会跑出不同的结果

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2. 各种msd图形鉴赏

统计的必要性

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image-20231019205733452

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