高精度数据集构建步骤

机器学习

发布时间 : 2024-08-10 14:04

字数:233

给每个文件分配文件夹

counter=0
for file in *;
do 
if [ -f "$file" ];then
    new_folder="$counter"
    mkdir -p "$new_folder"
    mv "$file" "$new_folder"
    counter="$((counter+1))"
fi
done

准备计算文件

for i in */;do cp my2poscar.py $i;cd $i;python my2poscar.py *.xsf POSCAR;cd ..;done

for i in */;do cp makepot.py $i;cd $i;python makepot.py ;cd ..;done
先找出所有的原子数为单胞的结构

grep -B 1 'Car' POSCAR | awk '/Car/ {print $0}' > atom_number.dat

grep 72 atom_number.dat > 72.dat

grep 144 atom_number.dat > 144.dat

可以做两遍，把那些原子数多的都删除掉

对找出的单胞进行高精度自洽计算
检验有没有没有进行计算的目录(找OSZICAR)

find . -type d ! -exec test -e '{}/OSZICAR' \; -print
检查有哪些没有计算成功

grep -rl "vasp.6.1.0" */OUTCAR | xargs grep -L "CPU"

构建数据集，进行新的机器学习势训练

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